ご利用、ありがとうございます。

メンバー管理を組み込む場合は、元のCMSとメンバー管理の2つのデータファイルを使用します。
メンバー管理は、member.phpファイル中の

// データベースファイルの場所と名前
$DB_URI = "data/member.sqlite";

この部分と実際のデータファイルの名前を同じものに変更してください。
CMSは、setup.phpの

// データベースファイルの場所と名前
$db_file = "data/cmsdb.sqlite";

この部分を修正してください。
現状のエラーを見ると、member.phpは修正されていない状態で、データファイル
data/member.sqliteの名前だけ変更されているのではないでしょうか。

いったん元の状態に戻して、メンバー管理、CMSと順番に変更すると
良いかもしれません。