CMSのバックアップは定期的に

管理ページで登録したデータは、dataフォルダのsqliteファイルに保存されます。（dataフォルダ名は、マニュアルに沿って変更されていると思います。）

また、画像やファイル類はuser_dataフォルダに保存されます。

sqliteファイルは壊れてしまう可能性もある為、これらの定期的なバックアップを行いましょう。
簡易的でいいならsqliteのみのバックアップでも構いませんが、この場合は当然、user_data画像とのずれが出てきます。大幅な改造をする際は、CMS全体のバックアップをとっておきましょう。